วิธีแปลงไฟล์ TXT เป็น FASTA

มีการศึกษาทางคลินิกเพื่อวิเคราะห์ข้อมูลลำดับโปรตีนและค้นหาวิธีรักษาโรค ข้อมูลลำดับโปรตีนถูกใส่ในรูปแบบ FASTA (fast-all) เพื่อให้โปรแกรมซอฟต์แวร์เข้าใจวิธีประมวลผลลำดับข้อมูล รูปแบบ FASTA มีอักขระสูงสุด 80 ตัวต่อบรรทัดข้อมูลลำดับ และใช้มาตรฐานรหัส IUB/IUPAC (International Union of Biochemistry/International Union of Pure and Applied Chemistry) การแปลงไฟล์ TXT (ข้อความธรรมดา) เป็นรูปแบบ FASTA เกี่ยวข้องกับการแก้ไขหรือเพิ่มข้อมูลลำดับที่จัดรูปแบบ FASTA ลงในไฟล์ข้อความที่มีอยู่ด้วยบรรทัดข้อมูลลำดับโปรตีน โปรแกรมแก้ไขข้อความเช่น Notepad ทำให้สิ่งนี้ทำได้ง่าย

เปิดไฟล์ข้อความลำดับโปรตีนที่คุณต้องการแก้ไขในโปรแกรมแก้ไขข้อความ เช่น Notepad

แก้ไขหรือเพิ่มบรรทัดรายละเอียดเพื่อให้เป็นไปตามรูปแบบ FASTA ตัวอย่างเช่น >gi|129295|sp|P01013|OVAX_CHICK GENE X PROTEIN (OVALBUMIN-RELATED) เป็นบรรทัดรายละเอียด FASTA ที่ถูกต้อง บรรทัดนี้มีคำอธิบายเฉพาะสำหรับบรรทัดข้อมูลลำดับที่ตามมา รูปแบบ FASTA ต้องใช้สัญลักษณ์มากกว่า (>) เพื่อให้โปรแกรมซอฟต์แวร์สามารถระบุข้อมูลคำอธิบายเฉพาะและหลีกเลี่ยงการประมวลผลคำอธิบายเป็นบรรทัดลำดับข้อมูลโปรตีน

กดปุ่ม "Enter" เพื่อแทรกตัวแบ่งบรรทัดเมื่อแก้ไขบรรทัดรายละเอียดแล้ว

แก้ไขหรือเพิ่มรูปแบบบรรทัดข้อมูลลำดับโปรตีนเพื่อให้สอดคล้องกับรหัสมาตรฐาน IUB/IUPAC มาตรฐาน IUB/IUPAC ใช้ตัวอักษรเพื่อแสดงรหัสที่ยอมรับได้หรือลำดับการสืบค้นสำหรับกรดอะมิโนหรือกรดนิวคลีอิกในรูปแบบ FASTA ตัวอย่างเช่น QIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAE แทนบรรทัดหนึ่งของข้อมูลลำดับที่ถูกต้อง เนื่องจากมันขึ้นต้นด้วยตัวอักษร "Q" ซึ่งแทนกลูตามีน และลงท้ายด้วยตัวอักษร "E" ซึ่งแสดงถึงกลูตาเมต

เพิ่มบรรทัดข้อมูลลำดับ แก้ไขบรรทัดข้อมูลลำดับที่มีอยู่ หรือเพิ่มตัวแบ่งบรรทัดหลังจาก 80 อักขระตามต้องการ การปฏิบัติตามมาตรฐานบรรทัดข้อมูลลำดับ FASTA และการขึ้นบรรทัดใหม่ช่วยให้แน่ใจว่าโปรแกรมปฏิบัติตามคำแนะนำที่เกี่ยวข้องกับกลูตามีน กลูตาเมต และรหัสตัวอักษรอื่นๆ ตัวอักษรในมาตรฐาน IUB/IUPAC เป็นเพียงคำแนะนำสำหรับโปรแกรมซอฟต์แวร์ที่ประมวลผลข้อมูลที่จัดรูปแบบ FASTA

คลิก "ไฟล์" เลือก "บันทึก" จากนั้นคลิกปุ่ม "บันทึก" ไฟล์ TXT ของคุณอยู่ในรูปแบบ FASTA แล้ว